Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS9Q3SYG4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BBS9Q3SYG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS9Q3SYG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBS9Q3SYG4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms