Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00303Q3SY05 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00303Q3SY05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00303Q3SY05 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00303Q3SY05 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.5 ms