Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NBPF1Q3BBV0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
NBPF1Q3BBV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NBPF1Q3BBV0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NBPF1Q3BBV0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NBPF1Q3BBV0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NBPF1Q3BBV0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NBPF1Q3BBV0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NBPF1Q3BBV0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NBPF1Q3BBV0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NBPF1Q3BBV0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NBPF1Q3BBV0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
NBPF1Q3BBV0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NBPF1Q3BBV0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms