Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LTC4SQ16873 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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LTC4SQ16873 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LTC4SQ16873 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTC4SQ16873 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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