Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFIL3Q16649 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFIL3Q16649 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NFIL3Q16649 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
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