Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK2Q16620 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NTRK2Q16620 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTRK2Q16620 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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