Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms