Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYPL1Q16563 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYPL1Q16563 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYPL1Q16563 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms