Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL23Q16540 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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