Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NCOA1Q15788 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCOA1Q15788 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NCOA1Q15788 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NCOA1Q15788 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NCOA1Q15788 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
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