Protein–RNA interactions for Protein: Q15582

TGFBI, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBIQ15582 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGFBIQ15582 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFBIQ15582 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFBIQ15582 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFBIQ15582 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms