Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCF4Q15080 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCF4Q15080 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCF4Q15080 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCF4Q15080 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCF4Q15080 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms