Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MLC1Q15049 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MLC1Q15049 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLC1Q15049 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLC1Q15049 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLC1Q15049 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLC1Q15049 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLC1Q15049 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLC1Q15049 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLC1Q15049 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLC1Q15049 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLC1Q15049 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLC1Q15049 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLC1Q15049 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms