Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MELKQ14680 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MELKQ14680 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MELKQ14680 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MELKQ14680 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MELKQ14680 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MELKQ14680 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MELKQ14680 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MELKQ14680 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MELKQ14680 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MELKQ14680 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MELKQ14680 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MELKQ14680 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MELKQ14680 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MELKQ14680 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MELKQ14680 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MELKQ14680 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MELKQ14680 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MELKQ14680 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MELKQ14680 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MELKQ14680 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MELKQ14680 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MELKQ14680 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MELKQ14680 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MELKQ14680 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MELKQ14680 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MELKQ14680 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MELKQ14680 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MELKQ14680 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MELKQ14680 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MELKQ14680 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MELKQ14680 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MELKQ14680 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MELKQ14680 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MELKQ14680 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MELKQ14680 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MELKQ14680 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MELKQ14680 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MELKQ14680 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MELKQ14680 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MELKQ14680 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MELKQ14680 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MELKQ14680 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MELKQ14680 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MELKQ14680 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MELKQ14680 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MELKQ14680 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MELKQ14680 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MELKQ14680 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MELKQ14680 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MELKQ14680 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MELKQ14680 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MELKQ14680 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MELKQ14680 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MELKQ14680 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MELKQ14680 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MELKQ14680 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MELKQ14680 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MELKQ14680 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MELKQ14680 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MELKQ14680 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MELKQ14680 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MELKQ14680 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MELKQ14680 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MELKQ14680 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MELKQ14680 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MELKQ14680 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MELKQ14680 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MELKQ14680 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MELKQ14680 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MELKQ14680 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MELKQ14680 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MELKQ14680 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MELKQ14680 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MELKQ14680 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MELKQ14680 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MELKQ14680 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MELKQ14680 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MELKQ14680 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MELKQ14680 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MELKQ14680 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MELKQ14680 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MELKQ14680 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MELKQ14680 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MELKQ14680 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MELKQ14680 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MELKQ14680 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms