Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SCARF1Q14162 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SCARF1Q14162 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCARF1Q14162 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCARF1Q14162 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
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