Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CUL4BQ13620 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CUL4BQ13620 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CUL4BQ13620 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CUL4BQ13620 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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