Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF5Q13568 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF5Q13568 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRF5Q13568 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF5Q13568 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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