Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDE3BQ13370 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDE3BQ13370 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PDE3BQ13370 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDE3BQ13370 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDE3BQ13370 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
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