Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPFIA1Q13136 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIA1Q13136 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIA1Q13136 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIA1Q13136 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIA1Q13136 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
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