Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL28Q13084 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL28Q13084 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPL28Q13084 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPL28Q13084 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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