Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN31Q12999 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN31Q12999 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSPAN31Q12999 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN31Q12999 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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