Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFX4

Putative uncharacterized protein LOC100128554, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q0VFX4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q0VFX4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q0VFX4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q0VFX4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q0VFX4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q0VFX4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q0VFX4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q0VFX4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q0VFX4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q0VFX4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q0VFX4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q0VFX4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q0VFX4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q0VFX4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q0VFX4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q0VFX4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q0VFX4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q0VFX4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q0VFX4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q0VFX4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q0VFX4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q0VFX4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q0VFX4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q0VFX4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q0VFX4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q0VFX4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q0VFX4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q0VFX4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q0VFX4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q0VFX4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q0VFX4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q0VFX4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q0VFX4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q0VFX4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q0VFX4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q0VFX4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q0VFX4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q0VFX4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q0VFX4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q0VFX4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q0VFX4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q0VFX4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q0VFX4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q0VFX4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q0VFX4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q0VFX4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q0VFX4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q0VFX4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q0VFX4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q0VFX4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q0VFX4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q0VFX4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q0VFX4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q0VFX4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q0VFX4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q0VFX4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q0VFX4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q0VFX4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q0VFX4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q0VFX4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q0VFX4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q0VFX4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q0VFX4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q0VFX4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q0VFX4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q0VFX4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q0VFX4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q0VFX4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q0VFX4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q0VFX4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q0VFX4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q0VFX4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q0VFX4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q0VFX4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q0VFX4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q0VFX4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q0VFX4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q0VFX4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q0VFX4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q0VFX4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q0VFX4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q0VFX4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q0VFX4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q0VFX4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q0VFX4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q0VFX4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q0VFX4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q0VFX4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q0VFX4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q0VFX4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q0VFX4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q0VFX4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q0VFX4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q0VFX4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Q0VFX4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q0VFX4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q0VFX4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q0VFX4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q0VFX4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q0VFX4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms