Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCRN3Q0VDG4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCRN3Q0VDG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCRN3Q0VDG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms