Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMOD3Q0VAK6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LMOD3Q0VAK6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
LMOD3Q0VAK6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LMOD3Q0VAK6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMOD3Q0VAK6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms