Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 NUP53YMR153W 1428 nt7.39□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 SNF4YGL115W 969 nt7.39□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 FCP1YMR277W 2199 nt7.39□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 HAC1YFL031W 717 nt7.38□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 AIM2YAL049C 741 nt7.38□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.37□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 YLR112WYLR112W 420 nt7.37□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 YOR300WYOR300W 309 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 OSM1YJR051W 1506 nt7.36□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 HRB1YNL004W 1365 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 SKP1YDR328C 585 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 MRP1YDR347W 966 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 YIA6YIL006W 1122 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 SUN4YNL066W 1263 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 HAL5YJL165C 2568 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 EXG2YDR261C 1689 nt7.35□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 RDR1YOR380W 1641 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 BIM1YER016W 1035 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 PAC10YGR078C 600 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 YJL213WYJL213W 996 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 YJR142WYJR142W 1029 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 YMR074CYMR074C 438 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 YOR012WYOR012W 414 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 HMT1YBR034C 1047 nt7.34□□□□□ -1.23
VHS3Q08438 CDC7YDL017W 1524 nt7.33□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 YHC3YJL059W 1227 nt7.33□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 PZF1YPR186C 1290 nt7.33□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 YBL111CYBL111C 2004 nt7.33□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 CRN1YLR429W 1956 nt7.32□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 PIL1YGR086C 1020 nt7.32□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 ADE1YAR015W 921 nt7.32□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 CCW12YLR110C 402 nt7.32□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 CIT3YPR001W 1461 nt7.31□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 YDR476CYDR476C 675 nt7.31□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 GRH1YDR517W 1119 nt7.3□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 PHO85YPL031C 918 nt7.3□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 RPL43AYPR043W 279 nt7.3□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 HEL1YKR017C 1656 nt7.29□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 TRR1YDR353W 960 nt7.29□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 YCR061WYCR061W 1896 nt7.28□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 HHY1YEL059W 309 nt7.28□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 PET117YER058W 324 nt7.28□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 MSI1YBR195C 1269 nt7.28□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 SDH8YBR269C 417 nt7.28□□□□□ -1.24
VHS3Q08438 YGL081WYGL081W 963 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 YPR127WYPR127W 1038 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 PGI1YBR196C 1665 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 CDC13YDL220C 2775 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 MCH2YKL221W 1422 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 SRF1YDL133W 1314 nt7.27□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 SNU71YGR013W 1863 nt7.26□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 CIT2YCR005C 1383 nt7.26□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 NMA2YGR010W 1188 nt7.26□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 NUP84YDL116W 2181 nt7.26□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 DAL7YIR031C 1665 nt7.25□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 MTR3YGR158C 753 nt7.25□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 NPL6YMR091C 1308 nt7.25□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 TDP1YBR223C 1635 nt7.24□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 SHO1YER118C 1104 nt7.24□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 ERG27YLR100W 1044 nt7.24□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 SNT309YPR101W 528 nt7.24□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 PPS1YBR276C 2424 nt7.23□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 AMN1YBR158W 1650 nt7.22□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 EHD3YDR036C 1503 nt7.22□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 BUR6YER159C 429 nt7.22□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 COX16YJL003W 357 nt7.22□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 MIX17YMR002W 471 nt7.22□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 ARC35YNR035C 1029 nt7.22□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 DPM1YPR183W 804 nt7.22□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 EDC3YEL015W 1656 nt7.22□□□□□ -1.25
VHS3Q08438 YPL071CYPL071C 471 nt7.21□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 TOS1YBR162C 1368 nt7.2□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 KIN1YDR122W 3195 nt7.2□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 SOD2YHR008C 702 nt7.2□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 THR1YHR025W 1074 nt7.2□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 RIB1YBL033C 1038 nt7.2□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 ICL2YPR006C 1728 nt7.2□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 RBS1YDL189W 1374 nt7.2□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 DLD1YDL174C 1764 nt7.19□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 FUS3YBL016W 1062 nt7.19□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 CDC16YKL022C 2523 nt7.19□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 CYB2YML054C 1776 nt7.18□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 GFA1YKL104C 2154 nt7.18□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 YCR049CYCR049C 447 nt7.18□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 RRP46YGR095C 672 nt7.18□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 YML122CYML122C 381 nt7.18□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 SEC23YPR181C 2307 nt7.18□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 YPQ2YDR352W 954 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 RTC4YNL254C 1206 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 YBR226CYBR226C 411 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 IRC5YFR038W 2562 nt7.17□□□□□ -1.26
VHS3Q08438 TAH11YJR046W 1815 nt7.17□□□□□ -1.26
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