Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 SKP1YDR328C 585 nt6.04□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 ERP2YAL007C 648 nt6.04□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 RFS1YBR052C 633 nt6.04□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 VMA2YBR127C 1554 nt6.04□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 TKL2YBR117C 2046 nt6.03□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 YCR041WYCR041W 333 nt6.03□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 AIM2YAL049C 741 nt6.03□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 RIB1YBL033C 1038 nt6.03□□□□□ -1.44
HRD1Q08109 SRF1YDL133W 1314 nt6.02□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 CDC3YLR314C 1563 nt6.02□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 YJR142WYJR142W 1029 nt6.02□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 LOT6YLR011W 576 nt6.02□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 ADE1YAR015W 921 nt6.02□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 FCY2YER056C 1602 nt6.02□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 NUP57YGR119C 1626 nt6.02□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 ENB1YOL158C 1821 nt6.02□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 RGT2YDL138W 2292 nt6.01□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 SNF4YGL115W 969 nt6.01□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 HRB1YNL004W 1365 nt6.01□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 SUF3tG(CCC)D 72 nt6□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 YJL213WYJL213W 996 nt6□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 YGL081WYGL081W 963 nt5.99□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 CCW12YLR110C 402 nt5.99□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 DPH5YLR172C 903 nt5.99□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 CDC7YDL017W 1524 nt5.99□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 MHP1YJL042W 4197 nt5.99□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 CYC8YBR112C 2901 nt5.98□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 AIM3YBR108W 2844 nt5.98□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 TOS1YBR162C 1368 nt5.98□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 PET117YER058W 324 nt5.98□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 PIL1YGR086C 1020 nt5.98□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 PAM17YKR065C 594 nt5.98□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 RPL43AYPR043W 279 nt5.98□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 HAL5YJL165C 2568 nt5.97□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 MGM101YJR144W 810 nt5.97□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 YLR112WYLR112W 420 nt5.97□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 YMR074CYMR074C 438 nt5.97□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 SUN4YNL066W 1263 nt5.97□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 MSI1YBR195C 1269 nt5.97□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 SDH8YBR269C 417 nt5.97□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 RQC1YDR333C 2172 nt5.97□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 HXT2YMR011W 1626 nt5.96□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 RDR1YOR380W 1641 nt5.96□□□□□ -1.45
HRD1Q08109 EXG2YDR261C 1689 nt5.95□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 NMA2YGR010W 1188 nt5.95□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 CIT2YCR005C 1383 nt5.94□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 SEC23YPR181C 2307 nt5.94□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 SLX5YDL013W 1860 nt5.94□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 GTT3YEL017W 1014 nt5.93□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.93□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.93□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.93□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.93□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.93□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.93□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt5.93□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 RRN10YBL025W 438 nt5.93□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 YOR012WYOR012W 414 nt5.93□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 GYP8YFL027C 1494 nt5.92□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 PAC10YGR078C 600 nt5.92□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 HGH1YGR187C 1185 nt5.92□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 FUS3YBL016W 1062 nt5.92□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 PAU21YOR394W 495 nt5.92□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 PAU22YPL282C 495 nt5.92□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 YPR127WYPR127W 1038 nt5.92□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 PGI1YBR196C 1665 nt5.91□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 CBK1YNL161W 2271 nt5.91□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 NCA3YJL116C 1014 nt5.91□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 YML122CYML122C 381 nt5.91□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 DPM1YPR183W 804 nt5.91□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 EFM1YHL039W 1758 nt5.9□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 PET494YNR045W 1470 nt5.9□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 MTR3YGR158C 753 nt5.9□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 PHO85YPL031C 918 nt5.9□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 SNT309YPR101W 528 nt5.9□□□□□ -1.46
HRD1Q08109 NMT1YLR195C 1368 nt5.9□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 FET4YMR319C 1659 nt5.89□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 YPQ2YDR352W 954 nt5.89□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 ERG27YLR100W 1044 nt5.89□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 BRN1YBL097W 2265 nt5.88□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 FPR2YDR519W 408 nt5.88□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 THR1YHR025W 1074 nt5.88□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 TUB1YML085C 1344 nt5.88□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 KIN1YDR122W 3195 nt5.88□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 MCH2YKL221W 1422 nt5.88□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 TDP1YBR223C 1635 nt5.88□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 DOC1YGL240W 753 nt5.87□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 YLR358CYLR358C 564 nt5.87□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 MIX17YMR002W 471 nt5.87□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 ARC35YNR035C 1029 nt5.87□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 AMN1YBR158W 1650 nt5.87□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 GLN3YER040W 2193 nt5.86□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 DLD1YDL174C 1764 nt5.86□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 MKK1YOR231W 1527 nt5.86□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 MPE1YKL059C 1326 nt5.86□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 HHY1YEL059W 309 nt5.86□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 YOR343CYOR343C 327 nt5.86□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 POP1YNL221C 2628 nt5.85□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 AVT4YNL101W 2142 nt5.85□□□□□ -1.47
HRD1Q08109 EFT2YDR385W 2529 nt5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.7 ms