Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPN12Q05209 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPN12Q05209 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPN12Q05209 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPN12Q05209 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPN12Q05209 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms