Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OC90Q02509 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OC90Q02509 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OC90Q02509 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OC90Q02509 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OC90Q02509 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OC90Q02509 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OC90Q02509 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OC90Q02509 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OC90Q02509 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OC90Q02509 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OC90Q02509 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OC90Q02509 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OC90Q02509 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OC90Q02509 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OC90Q02509 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OC90Q02509 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OC90Q02509 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OC90Q02509 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OC90Q02509 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OC90Q02509 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OC90Q02509 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OC90Q02509 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OC90Q02509 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OC90Q02509 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OC90Q02509 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OC90Q02509 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OC90Q02509 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OC90Q02509 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OC90Q02509 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OC90Q02509 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OC90Q02509 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OC90Q02509 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OC90Q02509 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OC90Q02509 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OC90Q02509 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OC90Q02509 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OC90Q02509 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OC90Q02509 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OC90Q02509 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OC90Q02509 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OC90Q02509 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OC90Q02509 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OC90Q02509 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OC90Q02509 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OC90Q02509 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OC90Q02509 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OC90Q02509 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OC90Q02509 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OC90Q02509 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OC90Q02509 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OC90Q02509 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OC90Q02509 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OC90Q02509 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OC90Q02509 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OC90Q02509 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OC90Q02509 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OC90Q02509 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OC90Q02509 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OC90Q02509 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OC90Q02509 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OC90Q02509 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OC90Q02509 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OC90Q02509 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OC90Q02509 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OC90Q02509 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OC90Q02509 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OC90Q02509 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OC90Q02509 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OC90Q02509 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OC90Q02509 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OC90Q02509 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OC90Q02509 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OC90Q02509 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OC90Q02509 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OC90Q02509 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OC90Q02509 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OC90Q02509 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OC90Q02509 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OC90Q02509 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OC90Q02509 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OC90Q02509 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OC90Q02509 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OC90Q02509 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OC90Q02509 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OC90Q02509 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OC90Q02509 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OC90Q02509 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OC90Q02509 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OC90Q02509 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OC90Q02509 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OC90Q02509 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OC90Q02509 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OC90Q02509 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OC90Q02509 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OC90Q02509 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OC90Q02509 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OC90Q02509 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OC90Q02509 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OC90Q02509 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms