Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
EXOSC10Q01780 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EXOSC10Q01780 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC10Q01780 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC10Q01780 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EXOSC10Q01780 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms