Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF9Q00978 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF9Q00978 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms