Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKB2Q00653 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKB2Q00653 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKB2Q00653 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKB2Q00653 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms