Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK3Q00526 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK3Q00526 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK3Q00526 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK3Q00526 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK3Q00526 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK3Q00526 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK3Q00526 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK3Q00526 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDK3Q00526 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK3Q00526 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK3Q00526 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK3Q00526 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK3Q00526 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK3Q00526 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms