Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IRX5P78411 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX5P78411 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX5P78411 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX5P78411 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX5P78411 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX5P78411 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IRX5P78411 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX5P78411 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX5P78411 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX5P78411 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRX5P78411 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX5P78411 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX5P78411 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IRX5P78411 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRX5P78411 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX5P78411 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX5P78411 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX5P78411 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRX5P78411 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX5P78411 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRX5P78411 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX5P78411 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX5P78411 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX5P78411 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX5P78411 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IRX5P78411 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX5P78411 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX5P78411 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX5P78411 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX5P78411 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IRX5P78411 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRX5P78411 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX5P78411 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX5P78411 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX5P78411 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX5P78411 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IRX5P78411 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX5P78411 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IRX5P78411 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX5P78411 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX5P78411 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX5P78411 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX5P78411 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IRX5P78411 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX5P78411 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX5P78411 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX5P78411 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX5P78411 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX5P78411 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX5P78411 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX5P78411 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX5P78411 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX5P78411 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX5P78411 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX5P78411 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX5P78411 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX5P78411 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX5P78411 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX5P78411 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX5P78411 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX5P78411 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX5P78411 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX5P78411 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX5P78411 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX5P78411 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX5P78411 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX5P78411 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX5P78411 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX5P78411 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX5P78411 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX5P78411 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX5P78411 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX5P78411 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX5P78411 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX5P78411 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX5P78411 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX5P78411 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX5P78411 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX5P78411 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX5P78411 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX5P78411 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX5P78411 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX5P78411 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX5P78411 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX5P78411 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX5P78411 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX5P78411 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX5P78411 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX5P78411 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX5P78411 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX5P78411 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX5P78411 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX5P78411 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX5P78411 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX5P78411 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX5P78411 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX5P78411 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX5P78411 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX5P78411 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms