Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEP78395 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEP78395 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEP78395 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAMEP78395 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms