Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHC1P78364 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHC1P78364 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHC1P78364 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHC1P78364 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHC1P78364 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHC1P78364 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHC1P78364 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHC1P78364 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHC1P78364 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHC1P78364 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHC1P78364 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHC1P78364 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHC1P78364 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHC1P78364 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHC1P78364 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHC1P78364 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHC1P78364 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHC1P78364 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHC1P78364 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHC1P78364 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PHC1P78364 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHC1P78364 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHC1P78364 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHC1P78364 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHC1P78364 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHC1P78364 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHC1P78364 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHC1P78364 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHC1P78364 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHC1P78364 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHC1P78364 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHC1P78364 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHC1P78364 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHC1P78364 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHC1P78364 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHC1P78364 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHC1P78364 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHC1P78364 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHC1P78364 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHC1P78364 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHC1P78364 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHC1P78364 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHC1P78364 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHC1P78364 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHC1P78364 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHC1P78364 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHC1P78364 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHC1P78364 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHC1P78364 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHC1P78364 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHC1P78364 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHC1P78364 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PHC1P78364 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHC1P78364 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHC1P78364 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHC1P78364 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHC1P78364 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHC1P78364 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHC1P78364 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHC1P78364 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHC1P78364 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHC1P78364 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHC1P78364 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHC1P78364 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHC1P78364 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHC1P78364 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHC1P78364 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHC1P78364 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHC1P78364 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHC1P78364 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHC1P78364 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHC1P78364 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHC1P78364 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PHC1P78364 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHC1P78364 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHC1P78364 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHC1P78364 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHC1P78364 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHC1P78364 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHC1P78364 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHC1P78364 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHC1P78364 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHC1P78364 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHC1P78364 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHC1P78364 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHC1P78364 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHC1P78364 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHC1P78364 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHC1P78364 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHC1P78364 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHC1P78364 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHC1P78364 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHC1P78364 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHC1P78364 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHC1P78364 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHC1P78364 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHC1P78364 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHC1P78364 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHC1P78364 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms