Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTG1P63261 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACTG1P63261 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTG1P63261 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms