Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL23AP62750 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL23AP62750 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL23AP62750 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL23AP62750 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL23AP62750 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms