Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS4XP62701 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS4XP62701 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS4XP62701 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms