Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO4P61968 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LMO4P61968 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO4P61968 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO4P61968 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO4P61968 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO4P61968 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO4P61968 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO4P61968 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO4P61968 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LMO4P61968 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMO4P61968 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMO4P61968 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LMO4P61968 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LMO4P61968 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMO4P61968 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMO4P61968 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMO4P61968 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMO4P61968 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMO4P61968 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LMO4P61968 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LMO4P61968 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LMO4P61968 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMO4P61968 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMO4P61968 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMO4P61968 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMO4P61968 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LMO4P61968 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMO4P61968 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LMO4P61968 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMO4P61968 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMO4P61968 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LMO4P61968 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMO4P61968 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMO4P61968 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMO4P61968 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LMO4P61968 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LMO4P61968 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LMO4P61968 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LMO4P61968 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LMO4P61968 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LMO4P61968 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LMO4P61968 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LMO4P61968 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LMO4P61968 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LMO4P61968 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LMO4P61968 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LMO4P61968 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LMO4P61968 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LMO4P61968 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LMO4P61968 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LMO4P61968 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LMO4P61968 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LMO4P61968 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LMO4P61968 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LMO4P61968 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LMO4P61968 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LMO4P61968 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LMO4P61968 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LMO4P61968 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
LMO4P61968 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LMO4P61968 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LMO4P61968 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LMO4P61968 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LMO4P61968 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LMO4P61968 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LMO4P61968 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LMO4P61968 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LMO4P61968 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LMO4P61968 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMO4P61968 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMO4P61968 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMO4P61968 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMO4P61968 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMO4P61968 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LMO4P61968 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMO4P61968 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMO4P61968 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMO4P61968 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMO4P61968 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMO4P61968 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LMO4P61968 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMO4P61968 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMO4P61968 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMO4P61968 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LMO4P61968 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMO4P61968 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMO4P61968 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMO4P61968 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMO4P61968 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMO4P61968 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMO4P61968 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMO4P61968 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMO4P61968 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMO4P61968 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMO4P61968 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMO4P61968 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMO4P61968 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMO4P61968 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMO4P61968 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms