Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P61574 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERVK_113P61574 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P61574 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms