Protein–RNA interactions for Protein: P61086

UBE2K, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2KP61086 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2KP61086 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE2KP61086 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2KP61086 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms