Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01547P58512 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01547P58512 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01547P58512 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01547P58512 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms