Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC8A3P57103 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC8A3P57103 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC8A3P57103 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC8A3P57103 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms