Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP1P56182 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP1P56182 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRP1P56182 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP1P56182 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP1P56182 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP1P56182 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP1P56182 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP1P56182 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRP1P56182 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP1P56182 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP1P56182 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP1P56182 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP1P56182 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRP1P56182 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RRP1P56182 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RRP1P56182 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RRP1P56182 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RRP1P56182 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRP1P56182 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRP1P56182 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RRP1P56182 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RRP1P56182 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RRP1P56182 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RRP1P56182 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRP1P56182 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRP1P56182 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRP1P56182 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRP1P56182 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRP1P56182 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRP1P56182 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRP1P56182 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRP1P56182 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRP1P56182 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RRP1P56182 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRP1P56182 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RRP1P56182 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RRP1P56182 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RRP1P56182 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRP1P56182 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRP1P56182 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RRP1P56182 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRP1P56182 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRP1P56182 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRP1P56182 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RRP1P56182 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RRP1P56182 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RRP1P56182 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RRP1P56182 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RRP1P56182 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RRP1P56182 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RRP1P56182 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RRP1P56182 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RRP1P56182 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRP1P56182 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRP1P56182 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRP1P56182 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRP1P56182 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRP1P56182 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RRP1P56182 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRP1P56182 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
RRP1P56182 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RRP1P56182 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RRP1P56182 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRP1P56182 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RRP1P56182 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRP1P56182 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RRP1P56182 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RRP1P56182 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RRP1P56182 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RRP1P56182 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RRP1P56182 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RRP1P56182 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
RRP1P56182 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRP1P56182 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RRP1P56182 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
RRP1P56182 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP1P56182 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP1P56182 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP1P56182 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP1P56182 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RRP1P56182 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP1P56182 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP1P56182 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP1P56182 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP1P56182 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RRP1P56182 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP1P56182 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP1P56182 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP1P56182 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RRP1P56182 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP1P56182 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP1P56182 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP1P56182 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP1P56182 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RRP1P56182 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP1P56182 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP1P56182 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP1P56182 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RRP1P56182 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms