Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTTPP55157 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTTPP55157 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTTPP55157 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTTPP55157 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTTPP55157 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTTPP55157 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTTPP55157 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTTPP55157 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTTPP55157 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTTPP55157 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTTPP55157 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTTPP55157 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTTPP55157 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTTPP55157 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTTPP55157 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTTPP55157 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTTPP55157 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTTPP55157 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTTPP55157 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTTPP55157 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTTPP55157 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTTPP55157 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTTPP55157 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTTPP55157 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTTPP55157 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTTPP55157 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTTPP55157 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTTPP55157 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTTPP55157 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTTPP55157 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTTPP55157 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTTPP55157 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTTPP55157 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTTPP55157 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTTPP55157 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTTPP55157 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTTPP55157 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTTPP55157 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTTPP55157 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTTPP55157 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTTPP55157 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTTPP55157 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTTPP55157 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTTPP55157 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MTTPP55157 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTTPP55157 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTTPP55157 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTTPP55157 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTTPP55157 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTTPP55157 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTTPP55157 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTTPP55157 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTTPP55157 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTTPP55157 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTTPP55157 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTTPP55157 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTTPP55157 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTTPP55157 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTTPP55157 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTTPP55157 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTTPP55157 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTTPP55157 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTTPP55157 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTTPP55157 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTTPP55157 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTTPP55157 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTTPP55157 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTTPP55157 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTTPP55157 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTTPP55157 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTTPP55157 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTTPP55157 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTTPP55157 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTTPP55157 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTTPP55157 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTTPP55157 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTTPP55157 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTTPP55157 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTTPP55157 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTTPP55157 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTTPP55157 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTTPP55157 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTTPP55157 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTTPP55157 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MTTPP55157 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MTTPP55157 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MTTPP55157 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTTPP55157 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTTPP55157 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTTPP55157 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTTPP55157 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTTPP55157 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTTPP55157 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTTPP55157 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTTPP55157 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MTTPP55157 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MTTPP55157 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTTPP55157 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MTTPP55157 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms