Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YARSP54577 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
YARSP54577 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YARSP54577 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
YARSP54577 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YARSP54577 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YARSP54577 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YARSP54577 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YARSP54577 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
YARSP54577 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
YARSP54577 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
YARSP54577 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
YARSP54577 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
YARSP54577 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
YARSP54577 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
YARSP54577 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
YARSP54577 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YARSP54577 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YARSP54577 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YARSP54577 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
YARSP54577 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YARSP54577 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
YARSP54577 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
YARSP54577 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YARSP54577 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YARSP54577 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YARSP54577 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YARSP54577 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YARSP54577 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YARSP54577 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YARSP54577 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YARSP54577 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YARSP54577 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YARSP54577 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
YARSP54577 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
YARSP54577 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YARSP54577 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YARSP54577 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YARSP54577 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YARSP54577 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YARSP54577 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
YARSP54577 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YARSP54577 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YARSP54577 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YARSP54577 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
YARSP54577 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
YARSP54577 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
YARSP54577 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
YARSP54577 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YARSP54577 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
YARSP54577 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YARSP54577 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YARSP54577 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YARSP54577 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
YARSP54577 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
YARSP54577 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YARSP54577 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YARSP54577 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
YARSP54577 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
YARSP54577 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YARSP54577 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YARSP54577 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
YARSP54577 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YARSP54577 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YARSP54577 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YARSP54577 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YARSP54577 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YARSP54577 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YARSP54577 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YARSP54577 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
YARSP54577 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
YARSP54577 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YARSP54577 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
YARSP54577 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
YARSP54577 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YARSP54577 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YARSP54577 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YARSP54577 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YARSP54577 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YARSP54577 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
YARSP54577 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YARSP54577 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
YARSP54577 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YARSP54577 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YARSP54577 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YARSP54577 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YARSP54577 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YARSP54577 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YARSP54577 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YARSP54577 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YARSP54577 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YARSP54577 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YARSP54577 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YARSP54577 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YARSP54577 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YARSP54577 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
YARSP54577 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
YARSP54577 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
YARSP54577 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YARSP54577 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms