Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 TCB1YOR086C 3561 nt7.33□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 TOS1YBR162C 1368 nt7.33□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 RMD8YFR048W 1989 nt7.32□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 SKP1YDR328C 585 nt7.32□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 YDR476CYDR476C 675 nt7.32□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 JIP4YDR475C 2631 nt7.31□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 MRP1YDR347W 966 nt7.31□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 QCR6YFR033C 444 nt7.31□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 VTS1YOR359W 1572 nt7.31□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 PRB1YEL060C 1908 nt7.31□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 MPA43YNL249C 1629 nt7.3□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 EDC3YEL015W 1656 nt7.29□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 NSE5YML023C 1671 nt7.29□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 ADE1YAR015W 921 nt7.29□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 MKK1YOR231W 1527 nt7.28□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 YJR142WYJR142W 1029 nt7.28□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 ATP4YPL078C 735 nt7.28□□□□□ -1.24
YNL058CP53947 YGL081WYGL081W 963 nt7.27□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 NCA3YJL116C 1014 nt7.27□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 YKL147CYKL147C 618 nt7.27□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 AIM2YAL049C 741 nt7.27□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 AFG3YER017C 2286 nt7.27□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 BDS1YOL164W 1941 nt7.27□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 PPS1YBR276C 2424 nt7.26□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 SHO1YER118C 1104 nt7.25□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 SNF4YGL115W 969 nt7.25□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 HMS2YJR147W 1077 nt7.25□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 YPL041CYPL041C 624 nt7.25□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 YFR006WYFR006W 1608 nt7.25□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 TOD6YBL054W 1578 nt7.25□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 NUP57YGR119C 1626 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 CDC3YLR314C 1563 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 ICL2YPR006C 1728 nt7.24□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 NMT1YLR195C 1368 nt7.23□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 YGL260WYGL260W 231 nt7.23□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 HXT15YDL245C 1704 nt7.22□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 HXT16YJR158W 1704 nt7.22□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 FLC2YAL053W 2352 nt7.22□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 PAM17YKR065C 594 nt7.22□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 CCW12YLR110C 402 nt7.22□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 FCY2YER056C 1602 nt7.22□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 CDC7YDL017W 1524 nt7.22□□□□□ -1.25
YNL058CP53947 YCR041WYCR041W 333 nt7.21□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 PET117YER058W 324 nt7.21□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 FZF1YGL254W 900 nt7.21□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 YTH1YPR107C 627 nt7.21□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 YBR226CYBR226C 411 nt7.21□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 PET494YNR045W 1470 nt7.2□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 CIT3YPR001W 1461 nt7.2□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.2□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 RFS1YBR052C 633 nt7.2□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 AGP2YBR132C 1791 nt7.2□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 HRB1YNL004W 1365 nt7.2□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 RIX7YLL034C 2514 nt7.2□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 ERP2YAL007C 648 nt7.19□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 YLR358CYLR358C 564 nt7.19□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 SDH8YBR269C 417 nt7.19□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 NMA2YGR010W 1188 nt7.18□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 PIL1YGR086C 1020 nt7.18□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 RPL43AYPR043W 279 nt7.18□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 MSI1YBR195C 1269 nt7.18□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 EXG2YDR261C 1689 nt7.18□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 YJL213WYJL213W 996 nt7.17□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 SSC1YJR045C 1965 nt7.17□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 RDR1YOR380W 1641 nt7.16□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 YOR389WYOR389W 1875 nt7.16□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 LCP5YER127W 1074 nt7.16□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 COG1YGL223C 1254 nt7.16□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.16□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 LOT6YLR011W 576 nt7.16□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 YMR074CYMR074C 438 nt7.15□□□□□ -1.26
YNL058CP53947 SLX5YDL013W 1860 nt7.15□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 POX1YGL205W 2247 nt7.15□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 EMW1YNL313C 2715 nt7.14□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 CDC16YKL022C 2523 nt7.14□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 YLR112WYLR112W 420 nt7.14□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 FUS3YBL016W 1062 nt7.14□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 YML122CYML122C 381 nt7.14□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 ENB1YOL158C 1821 nt7.13□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 CIT2YCR005C 1383 nt7.11□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 TUB1YML085C 1344 nt7.11□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 KAE1YKR038C 1161 nt7.11□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 SUN4YNL066W 1263 nt7.11□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 YOR012WYOR012W 414 nt7.11□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 PGI1YBR196C 1665 nt7.11□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 DOC1YGL240W 753 nt7.1□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 MTR3YGR158C 753 nt7.1□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 THR1YHR025W 1074 nt7.1□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 SNT309YPR101W 528 nt7.1□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 DPM1YPR183W 804 nt7.1□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 GAA1YLR088W 1845 nt7.1□□□□□ -1.27
YNL058CP53947 ERG12YMR208W 1332 nt7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.6 ms