Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ASCL1P50553 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASCL1P50553 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASCL1P50553 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ASCL1P50553 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ASCL1P50553 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms