Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GATMP50440 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GATMP50440 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GATMP50440 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GATMP50440 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GATMP50440 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GATMP50440 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GATMP50440 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GATMP50440 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GATMP50440 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GATMP50440 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GATMP50440 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GATMP50440 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GATMP50440 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GATMP50440 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GATMP50440 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GATMP50440 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GATMP50440 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GATMP50440 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GATMP50440 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GATMP50440 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GATMP50440 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GATMP50440 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GATMP50440 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GATMP50440 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GATMP50440 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GATMP50440 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GATMP50440 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GATMP50440 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GATMP50440 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GATMP50440 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GATMP50440 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GATMP50440 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GATMP50440 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GATMP50440 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GATMP50440 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GATMP50440 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GATMP50440 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GATMP50440 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GATMP50440 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GATMP50440 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GATMP50440 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GATMP50440 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GATMP50440 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GATMP50440 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GATMP50440 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GATMP50440 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GATMP50440 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GATMP50440 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GATMP50440 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GATMP50440 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GATMP50440 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GATMP50440 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATMP50440 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATMP50440 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATMP50440 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATMP50440 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATMP50440 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GATMP50440 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATMP50440 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATMP50440 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATMP50440 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GATMP50440 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GATMP50440 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GATMP50440 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GATMP50440 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GATMP50440 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GATMP50440 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GATMP50440 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GATMP50440 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GATMP50440 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GATMP50440 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GATMP50440 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GATMP50440 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GATMP50440 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GATMP50440 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GATMP50440 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GATMP50440 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GATMP50440 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATMP50440 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATMP50440 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATMP50440 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GATMP50440 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATMP50440 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GATMP50440 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GATMP50440 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GATMP50440 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GATMP50440 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GATMP50440 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GATMP50440 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GATMP50440 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GATMP50440 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GATMP50440 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GATMP50440 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GATMP50440 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GATMP50440 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GATMP50440 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GATMP50440 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GATMP50440 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GATMP50440 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms