Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCG1P45844 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCG1P45844 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms